지난번 포스트를 통해 자신의 컴퓨터에 터미널을 설치하고 실행하는 방법을 배웠다. 이번에는 터미널에서 사용되는 기본적인 명력어를 익혀 보기로 한다. 터미널에서 사용되는 명령어는 유닉스계열의 명령어를 사용한다. 리눅스와 같다. 맥과 리눅스 운영체제는 유닉스기반에서 만들어졌기 때문에 같은 명령어를 사용한다. 윈도우는 도스기반으로 만들어져서 다르다. 이번에 배울 명령어는 유닉스 계열의 명령어이다. 디렉토리(폴더) 안에 어떤 파일이 있는지 보고 싶을 때현재 내가 있는 폴더안에 어떤 파일이 있는지 보고 싶을 때 아래와 같이 입력하고 엔터를 누른다. List의 약자이다. ls 다른 폴더로 가고 싶을 때컴퓨터 파일 시스템은 트리 구조를 가지고 있다. 트리구조란 폴더안에 폴더.. 이런식으로 생각하면 된다. 현재 있는 폴..
Next-generation sequencing (NGS), Massive parallel seqeuncing, High-throughput sequencing 이라고 부르는 차세대 염기서열 분석법은 짧은 역사에 비해 생물학 발달에 지대한 공헌을 한 분석방법이다. 부르는 이름이 다양한 것은 그만큼 나온지 오래되지 않는 기술이고 사람마다 제각기 부르는 이름이 다랐기 때문이다. 최근에는 Next-generation sequencing (NGS)으로 수렴되는 분위기다. 이름이 다르지만 결국 '빠르게' '대량으로' '한꺼번에 많이' 시퀀싱을 하는 기술을 뜻한다. 생어 염기서열 분석1977년 개발되어 DNA 시퀀싱에 가장 고전적인 방법이며 오랜 기간동안 사용된 방법이다. NGS에는 속하지 않으며, 생어 시퀀싱이 ..
윈도우 환경에 익숙한 대부분의 사용자에게 커맨드라인(Command Line)은 바이오인포매틱스(Bioinformatics)로 들어가는데 가장 큰 허들일 것이다. 심지어 검색으로 나오는 대부분의 결과들이 이미 커맨드라인을 안다고 가정하고 있어서 "도대체 이걸 어떻게 실행하라는 거야!" 라는 생각이 들기도 한다. 본 블로그에서 소개하는 바이오인포매틱스, 파이썬 관련 포스트 들이 또한 커맨드라인을 사용하고 있다. 이 부분을 잘 모르는 사람들을 위해 '컴퓨터를 프로처럼 사용'하는 커맨드라인을 소개한다. 실제로 많은 프로그래머, 컴퓨터 전공자들이 아래와 같은 커맨드라인을 사용한다. 처음에는 조금 어려워 보일 수 있지만 조금만 시간을 들여 익숙해 진다면 컴퓨터 전공자처럼 컴퓨터를 사용할 수 있다!! 터미널 열기제일..